ANIMAL segmentation

CIVET을 사용해 본 사람이라면 ANIMAL template이라는 말은 한번쯤 들어봤을 듯 하다.

ANIMAL segmentation은 CIVET에서 segmentation 옵션으로 사용할 수 있는데, native T1 brain image를 linear registration과 nonlinear registration을 이용하여 template 영상에 매칭시킨 후 개개인의 brain을 ANIMAL label로 찍어내어 영역별로 분석할 수 있다. 주로 brain MRI의 volume 분석에서 많이 사용했다.

 

registration 전의 native space와 stereotaxic space 비교

왼쪽 : native T1 image / 중간 : stereotaxic space / 오른쪽 : overlay

 

registration 후

왼쪽 : registered native T1 영상 / 중간 : stereotaxic space / 오른쪽 : overlay

ANIMAL segmentation 된 registered T1 영상

왼쪽 : registered, ANIMAL segmented T1 영상 / 중간 : stereotaxic space / 오른쪽 : overlay

ANIMAL의 full name은 Automatic Nonlinear Image Matching and Anatomical Labeling으로.. 참 길다.