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멋지게 살고 싶다🐝 (이미지는 stable-diffusion으로 생성하였습니다.)
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얼마동안 윈도우 리눅스를 켜지 않다가 필요할 일이 있어서 eog를 띄웠는데 되지 않았다. 오류는 (eog:285): EOG-WARNING **: 22:04:22.333: EOG could not save some of your preferences in its settings directory due to a file with the same name (/home/beeline/.config/eog) blocking its creation. Please remove that file, or move it away. Unable to init server: Could not connect: Connection refused 찾아보니 DISPLAY 변수가 설정되어 있지 않았던 이유인 것 같다. # DISPL..
로컬, 원격 xming 오류 (Could not connect: Connection refused)얼마동안 윈도우 리눅스를 켜지 않다가 필요할 일이 있어서 eog를 띄웠는데 되지 않았다. 오류는 (eog:285): EOG-WARNING **: 22:04:22.333: EOG could not save some of your preferences in its settings directory due to a file with the same name (/home/beeline/.config/eog) blocking its creation. Please remove that file, or move it away. Unable to init server: Could not connect: Connection refused 찾아보니 DISPLAY 변수가 설정되어 있지 않았던 이유인 것 같다. # DISPL..
2019.05.08 -
CIVET을 사용해 본 사람이라면 ANIMAL template이라는 말은 한번쯤 들어봤을 듯 하다. ANIMAL segmentation은 CIVET에서 segmentation 옵션으로 사용할 수 있는데, native T1 brain image를 linear registration과 nonlinear registration을 이용하여 template 영상에 매칭시킨 후 개개인의 brain을 ANIMAL label로 찍어내어 영역별로 분석할 수 있다. 주로 brain MRI의 volume 분석에서 많이 사용했다. registration 전의 native space와 stereotaxic space 비교 registration 후 ANIMAL segmentation 된 registered T1 영상 ANIMA..
ANIMAL segmentationCIVET을 사용해 본 사람이라면 ANIMAL template이라는 말은 한번쯤 들어봤을 듯 하다. ANIMAL segmentation은 CIVET에서 segmentation 옵션으로 사용할 수 있는데, native T1 brain image를 linear registration과 nonlinear registration을 이용하여 template 영상에 매칭시킨 후 개개인의 brain을 ANIMAL label로 찍어내어 영역별로 분석할 수 있다. 주로 brain MRI의 volume 분석에서 많이 사용했다. registration 전의 native space와 stereotaxic space 비교 registration 후 ANIMAL segmentation 된 registered T1 영상 ANIMA..
2019.05.08 -
CIVET pipeline은 freesurfer처럼 brain MRI 영상을 종합적으로 분석해주는 완전 자동화된 소프트웨어이다. volume 분석 뿐만 아니라 cortical surface 분석도 가능하다. minctool, matlab으로 이용할 수 있는 surfstat과 많이 사용했던 프로그램이다. MRI 영상의 포맷은 .mnc로 MINC라고 부르기도 한다. 아직 범용적으로 .nii라는 NIFTI 포맷을 많이 사용하는 것 같다. minc를 많이 사용한 나로서는 조금 아쉽다. 비공개 파이프라인이라 어쩔 수 없는 듯 하다. CIVET pipeline은 비공개이긴 하지만 CBRAIN이라는 사이트로 CIVET pipeline을 이용할 수 있다. 내가 사용하던 CIVET pipeline output들의 의미에..
CIVET pipeline 결과 폴더 간략하게 정리CIVET pipeline은 freesurfer처럼 brain MRI 영상을 종합적으로 분석해주는 완전 자동화된 소프트웨어이다. volume 분석 뿐만 아니라 cortical surface 분석도 가능하다. minctool, matlab으로 이용할 수 있는 surfstat과 많이 사용했던 프로그램이다. MRI 영상의 포맷은 .mnc로 MINC라고 부르기도 한다. 아직 범용적으로 .nii라는 NIFTI 포맷을 많이 사용하는 것 같다. minc를 많이 사용한 나로서는 조금 아쉽다. 비공개 파이프라인이라 어쩔 수 없는 듯 하다. CIVET pipeline은 비공개이긴 하지만 CBRAIN이라는 사이트로 CIVET pipeline을 이용할 수 있다. 내가 사용하던 CIVET pipeline output들의 의미에..
2019.05.03 -
폭포수 개발은 일련의 작업 단계에 따라 순차적으로 개발하는 형태이다. 초반에 요구사항을 모두 분석하기 어렵고, 고객은 실제 제품을 프로젝트 후반부에 가서야 제대로 볼 수 있기 때문에 나중에 요구사항이 많이 변경된다는 단점이 있다. 최근에는 요구사항 분석과 제품의 주요 부분을 프로토타입이나 스토리보드로 만들어 고객의 검증을 받은 후 개발을 본격적으로 시작하는 프로토타입 모델을 많이 사용하여 이 단점을 개선하고 있다. - 폭포수 개발 프로세스 요구 분석(사용자 참여) > 설계 > 구현 > 테스트(사용자 참여) > 이행 - 프로토타입 개발 프로세스 요구 분석 > 프로토타입 개발 > 고객 평가(개선이 필요하면 다시 요구분석으로) > 설계 > 구현 > 테스트 > 이행 점진적 개발은 전체 시스템 요구사항을 분석한 ..
기존의 개발방법론과 애자일 개발방법론폭포수 개발은 일련의 작업 단계에 따라 순차적으로 개발하는 형태이다. 초반에 요구사항을 모두 분석하기 어렵고, 고객은 실제 제품을 프로젝트 후반부에 가서야 제대로 볼 수 있기 때문에 나중에 요구사항이 많이 변경된다는 단점이 있다. 최근에는 요구사항 분석과 제품의 주요 부분을 프로토타입이나 스토리보드로 만들어 고객의 검증을 받은 후 개발을 본격적으로 시작하는 프로토타입 모델을 많이 사용하여 이 단점을 개선하고 있다. - 폭포수 개발 프로세스 요구 분석(사용자 참여) > 설계 > 구현 > 테스트(사용자 참여) > 이행 - 프로토타입 개발 프로세스 요구 분석 > 프로토타입 개발 > 고객 평가(개선이 필요하면 다시 요구분석으로) > 설계 > 구현 > 테스트 > 이행 점진적 개발은 전체 시스템 요구사항을 분석한 ..
2019.05.01 -
초기 WSL에서는 GUI 인터페이스를 사용할 수 없다. 나는 vim이나 vi에 익숙하지 않았고, gedit이나 sublime text를 계속 사용해왔기 때문에 GUI가 안된다는 것은 큰 충격이었다. 하지만 늘 그렇듯이 사람들은 이미 내가 받은 충격을 이미 받았고, 답도 이미 있었다! Xming이라는 프로그램을 설치하면 어떤 GUI이든 켜지는 듯 하다. 설치하고 테스트 해보자. 1. Xming 다운로드를 검색하여 사이트에 접속하여 다운로드 한다. 사이트가 몇개 있는데 나는 https://sourceforge.net/projects/xming/ 에 접속하여 다운로드 했다. 2. Xming 설치 과정 3. WSL GUI 테스트 root@DESKTOP-UT5EI9F:/mnt/d/fsl# gedit Unable ..
Xming 설치 (윈도우 리눅스, WSL에서 GUI 사용하기)초기 WSL에서는 GUI 인터페이스를 사용할 수 없다. 나는 vim이나 vi에 익숙하지 않았고, gedit이나 sublime text를 계속 사용해왔기 때문에 GUI가 안된다는 것은 큰 충격이었다. 하지만 늘 그렇듯이 사람들은 이미 내가 받은 충격을 이미 받았고, 답도 이미 있었다! Xming이라는 프로그램을 설치하면 어떤 GUI이든 켜지는 듯 하다. 설치하고 테스트 해보자. 1. Xming 다운로드를 검색하여 사이트에 접속하여 다운로드 한다. 사이트가 몇개 있는데 나는 https://sourceforge.net/projects/xming/ 에 접속하여 다운로드 했다. 2. Xming 설치 과정 3. WSL GUI 테스트 root@DESKTOP-UT5EI9F:/mnt/d/fsl# gedit Unable ..
2019.04.28 -
FSL은 뇌영상처리에서 볼륨 분석을 할 때 많이 쓰이고, NIFTI나 ANALYZE 포맷 파일을 다룰 수 있는 툴이다. 나는 MINC 포맷을 많이 사용하여서 그런지 minctool이 익숙하지만... 보편적으로 사용되는 포맷이 NIFTI이기 때문에 대학원생 때 처럼 내가 사용하고 싶은 포맷만을 사용할 수는 없게 되었다. 어쨌든 설치! 1. FSL 사이트에 접속한다. Download/Install 클릭. 귀찮다면 https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation 클릭. 2. 기본적인 사항들을 입력해주고 Register 버튼 클릭. 나는 Centos를 좋아한다(센밍아웃). 3. 최신 버전만을 올려놓는 것으로 보인다. Download FSL 6.0.1 클릭. 4...
FSL 설치FSL은 뇌영상처리에서 볼륨 분석을 할 때 많이 쓰이고, NIFTI나 ANALYZE 포맷 파일을 다룰 수 있는 툴이다. 나는 MINC 포맷을 많이 사용하여서 그런지 minctool이 익숙하지만... 보편적으로 사용되는 포맷이 NIFTI이기 때문에 대학원생 때 처럼 내가 사용하고 싶은 포맷만을 사용할 수는 없게 되었다. 어쨌든 설치! 1. FSL 사이트에 접속한다. Download/Install 클릭. 귀찮다면 https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation 클릭. 2. 기본적인 사항들을 입력해주고 Register 버튼 클릭. 나는 Centos를 좋아한다(센밍아웃). 3. 최신 버전만을 올려놓는 것으로 보인다. Download FSL 6.0.1 클릭. 4...
2019.04.28 -
드디어 Windows에서도 리눅스를 사용할 수 있다! 필자는 항상 가상머신을 이용해서 리눅스를 사용했었다. '언젠가 Windows에서 리눅스를 만들어주겠지...' 라는 막연한 생각이 현실이 되었다. WSL (Windows Subsystem for Linux)을 설치해보자! 1. 설치하기 전에 확인이 필요하다. - Windows 10 64비트 - 버전 1607 이상 - 컴퓨터의 계정을 이메일로 로그인 하였는지 설정 - 시스템 - 정보에서 사양을 확인할 수 있다. 2. 검색 - Windows 기능 켜기/끄기를 검색하고 실행한다. 3. Linux용 Windows 하위 시스템을 체크한다. ※ 개발자 모드를 활성화 해도 되고 안해도 상관없는 듯 하다. 개발자 모드를 활성화 하려면 검색 - 개발자 설정 - 개발자 ..
Windows 10에서 리눅스 설치 (WSL)드디어 Windows에서도 리눅스를 사용할 수 있다! 필자는 항상 가상머신을 이용해서 리눅스를 사용했었다. '언젠가 Windows에서 리눅스를 만들어주겠지...' 라는 막연한 생각이 현실이 되었다. WSL (Windows Subsystem for Linux)을 설치해보자! 1. 설치하기 전에 확인이 필요하다. - Windows 10 64비트 - 버전 1607 이상 - 컴퓨터의 계정을 이메일로 로그인 하였는지 설정 - 시스템 - 정보에서 사양을 확인할 수 있다. 2. 검색 - Windows 기능 켜기/끄기를 검색하고 실행한다. 3. Linux용 Windows 하위 시스템을 체크한다. ※ 개발자 모드를 활성화 해도 되고 안해도 상관없는 듯 하다. 개발자 모드를 활성화 하려면 검색 - 개발자 설정 - 개발자 ..
2019.04.28