MRI
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성인 체중의 60% 이상은 체액으로 이루어져 있고, 그 대부분은 물로 구성된다. 물에 존재하는 수소 원자의 원자핵은 불규칙한 방향의 회전을 가지고 있다. 이 원자핵들을 강력한 자기장 속에 두면 원자핵의 회전 방향이 자기장을 따라 정렬(횡자화)된다. 이 상태에서 수직 방향의 고주파 펄스를 걸면 원자핵이 전자파 에너지를 흡수하여 자기장의 반대방향으로 회전의 방향이 바뀌게 된다. 그리고 펄스를 멈추게 되면 원자핵이 원래 상태로 돌아가게 되면서(종자화) 전자파를 방출하고 이 전자파를 검출하여 원자핵의 위치를 추적해 자기공명영상을 생성한다.
자기공명영상(Magnetic Resonance Imaging, MRI)성인 체중의 60% 이상은 체액으로 이루어져 있고, 그 대부분은 물로 구성된다. 물에 존재하는 수소 원자의 원자핵은 불규칙한 방향의 회전을 가지고 있다. 이 원자핵들을 강력한 자기장 속에 두면 원자핵의 회전 방향이 자기장을 따라 정렬(횡자화)된다. 이 상태에서 수직 방향의 고주파 펄스를 걸면 원자핵이 전자파 에너지를 흡수하여 자기장의 반대방향으로 회전의 방향이 바뀌게 된다. 그리고 펄스를 멈추게 되면 원자핵이 원래 상태로 돌아가게 되면서(종자화) 전자파를 방출하고 이 전자파를 검출하여 원자핵의 위치를 추적해 자기공명영상을 생성한다.
2019.05.17 -
CIVET을 사용해 본 사람이라면 ANIMAL template이라는 말은 한번쯤 들어봤을 듯 하다. ANIMAL segmentation은 CIVET에서 segmentation 옵션으로 사용할 수 있는데, native T1 brain image를 linear registration과 nonlinear registration을 이용하여 template 영상에 매칭시킨 후 개개인의 brain을 ANIMAL label로 찍어내어 영역별로 분석할 수 있다. 주로 brain MRI의 volume 분석에서 많이 사용했다. registration 전의 native space와 stereotaxic space 비교 registration 후 ANIMAL segmentation 된 registered T1 영상 ANIMA..
ANIMAL segmentationCIVET을 사용해 본 사람이라면 ANIMAL template이라는 말은 한번쯤 들어봤을 듯 하다. ANIMAL segmentation은 CIVET에서 segmentation 옵션으로 사용할 수 있는데, native T1 brain image를 linear registration과 nonlinear registration을 이용하여 template 영상에 매칭시킨 후 개개인의 brain을 ANIMAL label로 찍어내어 영역별로 분석할 수 있다. 주로 brain MRI의 volume 분석에서 많이 사용했다. registration 전의 native space와 stereotaxic space 비교 registration 후 ANIMAL segmentation 된 registered T1 영상 ANIMA..
2019.05.08 -
FSL은 뇌영상처리에서 볼륨 분석을 할 때 많이 쓰이고, NIFTI나 ANALYZE 포맷 파일을 다룰 수 있는 툴이다. 나는 MINC 포맷을 많이 사용하여서 그런지 minctool이 익숙하지만... 보편적으로 사용되는 포맷이 NIFTI이기 때문에 대학원생 때 처럼 내가 사용하고 싶은 포맷만을 사용할 수는 없게 되었다. 어쨌든 설치! 1. FSL 사이트에 접속한다. Download/Install 클릭. 귀찮다면 https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation 클릭. 2. 기본적인 사항들을 입력해주고 Register 버튼 클릭. 나는 Centos를 좋아한다(센밍아웃). 3. 최신 버전만을 올려놓는 것으로 보인다. Download FSL 6.0.1 클릭. 4...
FSL 설치FSL은 뇌영상처리에서 볼륨 분석을 할 때 많이 쓰이고, NIFTI나 ANALYZE 포맷 파일을 다룰 수 있는 툴이다. 나는 MINC 포맷을 많이 사용하여서 그런지 minctool이 익숙하지만... 보편적으로 사용되는 포맷이 NIFTI이기 때문에 대학원생 때 처럼 내가 사용하고 싶은 포맷만을 사용할 수는 없게 되었다. 어쨌든 설치! 1. FSL 사이트에 접속한다. Download/Install 클릭. 귀찮다면 https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation 클릭. 2. 기본적인 사항들을 입력해주고 Register 버튼 클릭. 나는 Centos를 좋아한다(센밍아웃). 3. 최신 버전만을 올려놓는 것으로 보인다. Download FSL 6.0.1 클릭. 4...
2019.04.28